CAI Técnicas Biológicas

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Actualización del Candida albicans PeptideAtlas y tutorial

19/03/2025

Describimos una nueva versión del PeptideAtlas de Cándida albicans (construcción 2024-03), que proporciona una cobertura de secuencia de proteína del 79.5% a nivel de proteína canónica, espectros de espectrometría de masas emparejados y evidencia experimental identificando 3382 y 536 sitios de serina y treonina fosforilados con tasas de localización errónea del 1% y 5.3%, respectivamente. Además proporcionamos un tutorial sobre cómo usar el PeptideAtlas y sus herramientas asociadas para acceder a esta información. La página web de resumen del PeptideAtlas de C. albicans ofrece información sobre la "Visión general de la construcción", "Cobertura de PTM", "Contribución experimental" y "Contribución del conjunto de datos". A través de Candida Genome Database se puede acceder a la información proteica y peptídica mediante hipervínculos en la entrada de cada proteína. Esto permite a los usuarios examinar los péptidos identificados, la cobertura de proteínas, las modificaciones postraduccionales (PTM) y los experimentos en los que se ha identificado cada proteína. Página web de Candida albicans PeptideAtlas: https://db.systemsbiology.net/sbeams/cgi/PeptideAtlas/buildDetails?atlas_build_id=578